Protein–RNA interactions for Protein: O55087

Mef2b, Myocyte-specific enhancer factor 2B, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mef2bO55087 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mef2bO55087 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mef2bO55087 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mef2bO55087 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mef2bO55087 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mef2bO55087 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mef2bO55087 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mef2bO55087 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mef2bO55087 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mef2bO55087 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mef2bO55087 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mef2bO55087 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mef2bO55087 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mef2bO55087 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mef2bO55087 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mef2bO55087 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mef2bO55087 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mef2bO55087 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mef2bO55087 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mef2bO55087 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mef2bO55087 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mef2bO55087 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mef2bO55087 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mef2bO55087 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms