Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copb2O55029 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copb2O55029 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copb2O55029 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copb2O55029 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms