Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole2O54956 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms