Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TsksO54887 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TsksO54887 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TsksO54887 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TsksO54887 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TsksO54887 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TsksO54887 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TsksO54887 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TsksO54887 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TsksO54887 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TsksO54887 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TsksO54887 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TsksO54887 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TsksO54887 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TsksO54887 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms