Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek2O35942 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek2O35942 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Nek2O35942 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Nek2O35942 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Nek2O35942 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Nek2O35942 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Nek2O35942 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Nek2O35942 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Nek2O35942 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek2O35942 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek2O35942 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms