Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms