Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd2O35927 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms