Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Tnfrsf18O35714 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf18O35714 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf18O35714 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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