Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1mwO35599 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms