Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KeraO35367 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KeraO35367 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KeraO35367 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KeraO35367 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KeraO35367 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KeraO35367 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KeraO35367 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms