Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptpn9O35239 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ptpn9O35239 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ptpn9O35239 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ptpn9O35239 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptpn9O35239 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ptpn9O35239 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ptpn9O35239 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptpn9O35239 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ptpn9O35239 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptpn9O35239 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptpn9O35239 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ptpn9O35239 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptpn9O35239 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptpn9O35239 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ptpn9O35239 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms