Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe40O35185 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms