Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EllO08856 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EllO08856 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EllO08856 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EllO08856 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EllO08856 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EllO08856 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EllO08856 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EllO08856 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EllO08856 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EllO08856 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EllO08856 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EllO08856 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EllO08856 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EllO08856 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EllO08856 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EllO08856 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EllO08856 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EllO08856 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EllO08856 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EllO08856 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EllO08856 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EllO08856 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EllO08856 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EllO08856 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EllO08856 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EllO08856 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EllO08856 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EllO08856 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms