Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r88L7N1W8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r88L7N1W8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms