Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms