Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp16-psI6L890 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp16-psI6L890 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms