Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn20G5E8X0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms