Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms