Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgef1G3X9K3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgef1G3X9K3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms