Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmigd3G3X8R9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms