Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubap1lG3UW59 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1lG3UW59 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms