Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm28048F7BCN0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm28048F7BCN0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm28048F7BCN0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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