Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8247F6VRJ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms