Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngap1F6SEU4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms