Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms