Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Raph1F2Z3U3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms