Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmod3E9QA62 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms