Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cald1E9QA15 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms