Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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