Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms