Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms