Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc141E9Q8Q6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc141E9Q8Q6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc141E9Q8Q6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc141E9Q8Q6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc141E9Q8Q6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc141E9Q8Q6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms