Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Simc1E9Q6E9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms