Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc85cE9Q6B2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms