Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DspE9Q557 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DspE9Q557 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms