Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r238E9Q373 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms