Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrp3E9Q1T6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Lrp3E9Q1T6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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