Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms