Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc1E9PZP8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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