Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf11E9PZM7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms