Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd1E9PZ26 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms