Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms