Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms