Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abca16E9PWJ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abca16E9PWJ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms