Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc17E9PVB5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms