Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms