Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms