Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt2E9PUL5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt2E9PUL5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms