Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ38

Gm45062, Predicted gene 45062, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45062E0CZ38 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm45062E0CZ38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms