Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms